من مؤلفات السيّد محمد سعيد الحكيم قدس سرّه التي انتفعتُ منها كثيراً وقرأتها لأكثر من مرة وسأعيد قراءتها لأهميّة مطالبها: فاجعة الطف، في رحاب العقيدة، الإمام الثاني عشر. 

السيد الحكيم علاقته عجيبة وعظيمة مع القلم والتأليف وزكاة العلم، فقد ألّف عدّة كتب وهو في السجن مستعيناً بأوراق علب السجائر!
ومنها:
1 ـ دورة في تهذيب علم الأصول، حيث أكملها بعد الإعتقال وطبعت بعنوان «الكافي في الأصول».

2 ـ كتاب الخمس، وهو كتاب فقهي استدلالي، يتضمن جانباً من البحوث الفقهية التي درّسها في السجن.

3 ـ كتاب في مباحث الأصول العملية، ألّفه اعتماداً على ذاكرته، لكنه أُتلف خشية عثور السلطات الأمنية عليه عند قيامها بتفتيش السجن.

4 ـ كتاب في سيرة النبي (صلى الله عليه وآله) والأئمة (عليهم السلام) كتبه اعتماداً على ذاكرته ليكون مرجعاً لمحاضرات ثقافية اسلامية حيث لم يكن هناك أي مصدر، لكنه أُتلف أيضاً. 

ويُنقل أن السيد قبل يوم من وفاته أرسل كتاباً الى المطبعة يخص أمير المؤمنين صلوات الله عليه.
وكتاب آخر باسم (خاتم النبيين) سوف تكتمل طباعته.