بعد أن عكفت ملاكات دار القرآن الكريم في العتبة الحسينية المقدسة، على مشروع هو الأضخم من نوعه , أنجز العاملون منذ انطلاق المشروع سنة 2011 في كتابة موسوعة تتضمن ستين مجلد , اذ تم كتابة موسوعة متكاملة حول ما ورد عن النبي وأهل بيته صلوات الله عليهم في القرآن الكريم, وقال مسؤول البحوث والدراسات القرآنية في الدار السيد مرتضى جمال الدين "إن الدار عملت على إصدار هذه الموسوعة لبيان علوم النبي محمد وأهل بيته عليهم السلام في القرآن الكريم وأنهم عدل القرآن, وتم تصنيفها على الأساس الموضوعي لها". وأضاف، "موسوعة اهل البيت القرآنية تقع في 60 مجلداً كمرحلة نهائية". مبينا, ان شعبة البحوث والدراسات القرآنية التابعة في الدار عكفت على إنجاز الموسوعة منذ أربع أعوام". وتعد الموسوعة القرآنية واحدة من أوسع المشاريع القرآنية وأهمها التي أطلقتها الدار في مجال التصنيف الموضوعي للروايات الشريفة الواردة عن أهل البيت عليهم السلام في بيان الآيات القرآنية. وذكر جمال الدين, ان 35 الف نص روائي ورد عن أهل البيت تضمنته الموسوعة, الى جانب 17 عشر الف آية من المبحوث عنه في القرآن الكريم عن أهل البيت عليهم السلام. مؤكدا, "لأول مرة تكتب موسوعة متكاملة الجوانب حول ما ذكر في القرآن الكريم عن أهل البيت عليهم السلام". واشترك في هذا المشروع الضخم لجان عديدة واعدت الخطط اللازمة لإتمامه فضلا عن الهيئة الاستشارية المكونة من العلماء في النجف الأشرف منهم العلامة السيد محمد صادق الخرسان والعلامة السيد فاضل الجابري والعلامة الشيخ مصطفى العاملي والعلامة السيد محمد علي الحلو ونخبة من أساتذة جامعة كربلاء و طلبة العلوم الدينية المتخصصين في البحوث والدراسات, وقال السيد مرتضى جمال الدين, إن "خمسة أعوام متتالية استغرقتها كتابة الموسوعة لترى النور أخيراً , فمنذ سنة 2011 ولغاية الان عكف العاملون على إتمام جميع جوانبها المتعددة حسب الخطة المعدة". وأضاف, "الموسوعة موزعة على ثلاثة مجاميع منها المجموعة القرآنية والمتكونة من 20 مجلد وهي ما ورد عن أهل البيت عليهم السلام بالقرآن, والمجموعة الثانية تعرف بالعقائدية تضمنت أصول الدين وفروع الدين, اما المجموعة الثالثة سميت بالفقهية اختصت بفروع الدين والقضاء والديات والطهارة". وهناك مجلد انفرد عن بقية المجلدات بموضوعاته المختلفة حيث اختص بالفهارس ودليل الموسوعة. ومن الأهداف الموضوعة للموسوعة هو البيان التفصيلي لحديث الثقلين عن النبي الأكرم صلى الله عليه واله, (إني تارك فيكم الثقلين كتاب الله وعترتي أهل بيتي) كما ذكر مرتضى جمال الدين. لافتا, "لا يبين القرآن الا عدل القرآن أي النبي وأهل بيته (عليهم السلام) فإذا جئنا بالآيات القرآنية ووجدنا اي بيان للائمة عليهم السلام يضمن في احدى المجلدات ويتم تصنيفه حسب مضمون الآية الكريمة".وكشف مسؤول البحوث والدراسات القرآنية عن مشروع إنزال المجلدات في تطبيق قرآني على شبكة الانترنيت العنكبوتية وايضا قرص ذكي ليتسنى للجميع من تداوله بصورة أوسع.